Οι κύριοι στόχοι της ΣΕΚ Λεμεσού είναι η προστασία και η διασφάλιση των εργαζομένων μέσα από τη συλλογική διαπραγμάτευση και τη συνομολόγηση συλλογικών συμβάσεων και ο επηρεασμός των αρμόδιων σωμάτων για τη δημιουργία εργασιακής και οικονομικής πολιτικής μέσα απο τον κοινωνικό διάλογο σε εθνικό, κλαδικό και επιχειρησιακό επίπεδο.
Από την 1ην Σεπτεμβρίου 2020 ιδρύεται Ειδικό Συμπληρωματικό Ταμείο Ιατροφαρμακευτικής Περίθαλψης Μελών ΣΕΚ Λεμεσού, για κάλυψη κάποιων ωφελημάτων που δεν καλύπτονται από το ΓΕΣΥ.