Το Τμήμα Μηχανογράφησης της ΣΕΚ έχει ως σκοπό την αποτελεσματική χρήση και εφαρμογή της πληροφορικής μέσα στους κόλπους της ΣΕΚ, των μελών Ομοσπονδιών της και των Ελεύθερων Εργατικών Κέντρων. Για αυτό και διατηρεί πέντε κέντρα ηλεκτρονικών υπολογιστών σε επαρχιακό επίπεδο.
Την παροχή υποστήριξης προς τους χρήστες σε θέματα εφαρμογών την αναλαμβάνει το Τμήμα με μεγάλη επιτυχία. Η παροχή υποστήριξης επεκτείνεται και σε θέματα υλικού (ηλεκτρονικοί υπολογιστές, εκτυπωτές, υποδομή δικτύου κλπ). Ένα άλλο σημαντικό κομμάτι είναι και η διαρκείς εκπαίδευση των χρηστών στις υφιστάμενες και καινούριες εφαρμογές. Το Τμήμα παρακολουθεί και ενημερώνεται συνεχώς για τις τελευταίες εξελίξεις στον τομέα της πληροφορικής και προσπαθεί να τις εφαρμόζει όπου κρίνει αναγκαίο.